大多数忍者的实践知识可用“通感”或“意识”来代替。这种知识在常规教育体系或书本中找不到，所以忍术家族依赖口头教学和一些有益的经验来传递先辈的知识。
基于忍者远不及有严格荣誉，礼仪准则的武士的高贵地位，忍者可以自由运用他们遗产中的自然主义。忍术哲学强调宇宙万物相互联系，同为一元。由于人们不能一眼看到整个世界，哲学解释展现在人们眼前的无数的宇宙部分为“万物”或每个事物都是独立存在的。透视这个景象，所有事物都可归类为阴、阳或肯定、否定。例：明暗、天地、男女、强弱、干湿、分集以及无数两极对。
阴阳分类法不只是简单的对立物组合，他给了忍者一种认知，使他们摆脱把事物分为对错，好坏，公平与不公平的局限，他们认为相同质的不同现象相互关联。对西方人有时接受甚至理解这种不严格的伦理或规律都是困难的。确实，这种伸缩性的概念和许多当代武术体系哲学理论相驳。忍者的生活观着重整个画面，不断变化的结果重于实现的方式。
忍者最重要的政治贡献是维持社会的平衡和协调。如果勇敢的千军万马的冲锋是战争的正面，那秘密截获敌电或抓获敌长官本人就是战争的一个否定或和缓、协调。敌人称做为“欺骗、胆小、变节”忍者则称之为“策略、狡猾、机智。”
忍者学习运用忍术的根本目的不仅是为了获得登峰造极的暴力和毁灭手段，而且要培养个人同周围环境的协调，从而产生一种使生来具有道德 人类知道并跟随这种穿越宇宙总纲行动的直觉。
忍术，又名隐术，即隐身术。日本十七世纪的日本幕府时代，随着日本宫廷追捕，武术阶级势力的上升及间谍工作的需要，出现了越来越多的忍术高手——“忍者”，忍术也日渐盛行，德川幕府时发展到顶峰。但长期以来，忍术仅为忍者家族世代秘传，外界则很难知其详貌。忍术强调精神上的修炼，并将其整个的训练体系，建立在超乎想象的精神修炼基础上，可以说，强大的精神力量，是忍术之所以无坚不摧的真正原因。
在战国时代，忍术得到了进一步的发展，并且形成了很多的派别。其中以伊贺与甲贺两地为本。其它的有青森中川流、山形羽黑流、新泻上杉流、加治流、长野甲阳流、芥川流等。这是一个非常需要忍术的时代。忍者的生命不属于自己，而是属于他们的主人，或者某个组织。为了主人他们可以随时作出牺牲。对他们而言，生命的意义只在于那刺杀的一瞬，就像樱花一样，绽开最绚丽的时候也是它凋谢的时候，这也是日本民族心底深处对于”死”的诠释。因此忍者的身份地位虽然有待争议甚至有人认为其身份地位并不高，却依然是日本文化中一个非常重要的组成部分。
战国时代中，虽然同为大名服务，不过忍者和武士的身份分别可谓是台前和幕后，夸张的一些甚至是天上地下如忍者是家奴武士是家臣，但其实也要看具体情况而定。由于忍者们干的大都是涉及到上层权力争斗的秘密事件，而且危险性相当大，因此他们当中很多人的结局往往十分可悲。危险首先来自雇主。这些阴险毒辣的社会头面人物在不择手段达到自己的目的后，怕事情内幕泄露，会将执行任务的忍者杀死灭口。
忍者最可怕的敌人是武士。武士在明处，忍者在暗处，防不胜防，故武士最憎恨忍者，忍者一旦被武士捕获，必然受到最残酷的刑罚处死。活剥皮就是酷刑的一种，皮肤被一片片剥下来，极其痛苦，而又不能立即死掉。所以忍者是绝对不肯让武士活捉的。以前一位最富有传奇性的忍者的遭遇便验证了这个一点。这位忍者名叫猿飞，因为他有象猿猴一样在树上攀援飞跃的本领，来去无踪；同时他徒手格斗的武功也很好，人们根本无法捕捉他。有一次他被派去侦察住在某城堡中的一个将军，偷听到将军和一位大臣的密谈。可当他离开城堡时被守卫发现，他立即跃上城墙，巧妙地避开了追赶的人，但当他跳落花园时，踩上了一只暗设的捕熊钢夹，将他的腿紧紧夹住。这时将军手下的卫士围了上来，猿飞见状，一刀将夹住的腿砍断，单脚逃了很长一段距离。可终因失血过多，难以支持。猿飞见卫士越来越近，知道自己没有希望逃脱，便索性站定、大声辱骂了追赶他的卫士，用剑毁掉自己的面容，使人无法辨认，然后挥剑砍断自己的的脖子。一个闻名遐迩的忍者就这样可悲地结束了自己的一生。
而在新时代，历代京都大将都将忍者作为了军队中不可或缺的一份战力。到了宮歩崎这一代，他更是大量招募忍者，并且广开忍者训练馆，培养杰出的忍者，宣布武士和忍者的地位等同，给予忍者极高的待遇。
而冲田驭手作为甲贺流上忍，更是全权担任了忍者军队的总统帅，地位隐隐比火力军统帅手田还要高出半分。
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