距离北原真树于树林内的‘圣经吟唱’已经过去了一个星期，东京的情报组织之间的碰撞愈发激烈，然而帝丹小学仍是和平依旧，只不过在下午做值日时，光彦急匆匆地跑进教室大喊道：
“不好了，不好了！柯南！大势不妙了啊！一个四年级的女生凭空消失了啊！”
柯南一听来了案子，立刻从萎靡不振的状态中恢复了过来，赶紧向光彦问道：
“发生了什么？”
“是这样的！她是四年级的雨宫祥子，因为她的姐姐和我的姐姐是朋友，所以我们一起玩过几次。昨天我明明和她约好了今天一起回家，但是我去她们班找她却发现她今天根本没来上学。哦，对了，她跟人的感觉就跟灰原同学差不多。”
听到这里，柯南还有灰原都对视了一眼，觉得事情不会这么巧吧……
这个时候，刚好柯南他们班的班主任小林老师走了进来，听到他们在讨论四年级的雨宫祥子同学时，为了让这群孩子们放心，她说道：
“其实雨宫同学今天本来预定是要请假的，因为他们家要去九州参加她叔叔的葬礼。可是昨天突然打电话说会正常上学。虽然今天她还是没来，但是也有可能突然是改变了预定，今天就去了九州。她们班的临时班导也是这么觉得的。”
“临时班导？”
“是啊，雨宫她们班原来的班主任出了车祸现在还在医院，那位临时班导就是前天来到我们学校的平田老师。现在平田老师也在联系雨宫的父母……好了，这些事情就交给大人来操心吧，现在已经是下午了，你们快点回家吧。”
原来的班主任出了车祸进了医院，然后突然出现了一名新老师，而且失踪的女孩跟灰原很想……
柯南和灰原此时开始担心了起来，现在灰原在北原真树的建议下留起了长发，并且还带上了贝尔摩德送给她的防蓝光眼镜，可以说在外表上和之前有了很大的不同。
但是那名四年级的女生要是被当成了和‘宫野志保’有关的人可就麻烦了，她甚至她们家都很可能遇上了危险。
十分自己的定位的灰原立刻打电话给了北原真树，跟他说清楚了前因后果之后，北原真树沉思了一会儿，给出了不太可能是黑衣组织的回答。
因为琴酒现在被之前北原真树的戏耍弄得火大得很，所以他最近一直在搜索到底是谁利用了板仓，还打算伏杀他，更重要的是那个软件磁盘，因为琴酒没有将它带回，所以让boss感到十分地不满，并且还暗示了最近琴酒的业务水平有所下滑——先是放走了宫野姐妹，现在是让本来应该十拿九稳的软件磁盘落入了别人的手中。
然后是可能关注到灰原哀的fbi则是被公安撵得到处跑，哪里还有什么精力去注意一个小学女孩。m.cascoo
不过求稳的北原真树则打算待会儿和贝尔摩德一起过去，伪装成假期当中被小孩们找出来玩游戏的大人，然后听取了孩子们的意见——去帮忙找一找那名失踪了的小女孩。
少年侦探团接下来去寻找关于那名失踪了的孩子的线索，发现最近的两三天中，她一直都是一个人回家，也不愿意和朋友说出原因，这让柯南和灰原都觉得那个女孩可能是察觉到了危险，但是独自一个人回家又不太合乎常理，难道说她最近有什么不能和别人说的秘密吗？
五个人在校园里收集完情报之后出了校园大门，打算现在就去雨宫家看一看，然后就看到了两个带着墨镜的人笑着向他们招手。
“是北原哥和伊芙琳姐姐。我们过去吧，到时候调查雨宫家的事情也能够方便很多。”
灰原快步向前拉着北原真树的衣袖走到一边，跟北原真树低声商量了起来，而贝尔摩德的表情则藏在阴影中，不知道在想着什么。
“啊，灰原同学和北原哥的关系好好啊。”
“嗯……我明白灰原同学的想法，毕竟无论是在网络上，还是在现实里面，北原哥一直都很帅啊。”
“诶，我觉得伊芙琳姐姐也很温柔，上面她还陪我们去宠物店看狗狗了。”
“光彦你买了一只宠物吗！”
“没有，伊芙琳姐姐说在我明白照顾宠物的责任之前不应该这么轻易地就要一只宠物，而且我也觉得养宠物要花好多功夫，所以没有买了。”
柯南呵呵哒地听着这群小鬼把话题拉偏到了养宠物的话题时，作为少年侦探团的智商担当，他立刻招呼三名小鬼赶紧跟上，还有跟她们说清楚这是要去找失踪的雨宫祥子，不是去做安室透的找猫找狗的委托。
当众人来到了雨宫家后摁了好几次门铃也没有人来应门。所以光彦从她们家的盆栽下找到了备用钥匙，看着北原真树问道：
“北原哥，我们可以进去吗？”
北原真树本来只是来确定会不会有什么意外的组织在寻找‘宫野姐妹’，所以他自然是不会在意这种擅闯别人家的做法的，不过警察作为他的表面职业总得要装出一副为难的样子，他面露难色地说道：
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