这是五大国当中首个特务组织，也是直属于火影的嫡系战斗力量，是扉间高超政治手腕的体现，被各国忍村争相效仿。
暗部的成员都是从村子里筛选出的优秀忍者，主要进行保护火影和预防外敌侵入木叶忍者村的工作，有时还负责侦察敌情和暗杀等任务，其成员行动时都戴着模仿动物的白色面具，任务性质及其他一切资料均保密。
暗部由火影直属，部队底下设多个分队，由分队长统一传达命令和领导执行任务。
在第二代火影的时代，千手扉间培养出以“虎”、“爆”、“牛”为代表的大量暗部成员，令他们负责监视宇智波一族。
木叶暗部共有70人，等级由上至下分别为：总队长和副总队长各一名，从二代火影千手扉间时期开始。
在三代火影猿飞日斩执政时期，三代火影的长子和儿媳（木叶丸的父母）担任暗部队长。
暗部下辖四个分队，每队各17人，每队设分队长一名，下辖四个班。
暗部的任务的性质一般极其恶劣或枯燥，比如看守重要嫌犯等。
由于任务的特殊性，暗部成员行动时都戴着模仿动物的白色面具，任务性质及其他一切资料均被机密保存。
暗部由影直属，一切命令由影发布，由分队长统一转达命令和领导执行任务。
任务时都是以代号而称。
木叶暗部成员通常身穿黑色紧身衣，外面穿一件白色背带衫，下装基本与其他忍者无异，有时也会套一件黑色风衣。
在暗部中，一般有两条规则。
规则一：死不留尸，还要会消灭尸体的痕迹。
规则二：在正常情况下执行任务时需戴面具。
此时的暗部基地中，猿飞日斩面容肃穆庄重，静静打量着眼前的暗部成员，这是战争结束后，身为三代目火影的他主持的首次叙功大会，全体暗部成员都得到了丰厚的奖励，包括金银珠宝、各式忍具、忍法卷轴、秘传忍术等等。
而当全体暗部成员集合的时候，要么，到了木叶生死存亡之际，要么，就是新旧更替的时候了。
陆玄百无聊赖地站在人群之中，神游天外。
他是在晋升中忍之后，就被波风水门拉入了暗部。
职责倒是不用出外勤，只是担当暗部的体术教官，教导暗部成员呼吸法。
是的，呼吸法被猿飞日斩列入A级秘传忍术，是唯有暗部成员才可以修炼的秘密忍术，作为奖励，陆玄从猿飞日斩那里得到了A级忍术，金刚封锁。
“为了火之意志，这么些年，辛苦诸位了！老朽在此拜谢“猿飞日斩摘下火影帽，向暗部成员鞠躬道：“与诸君一同战斗，老朽深感荣幸，现在，是时候，让新的火之意志熊熊燃烧了，我作为三代目火影，将卸下重担。”
暗部忍者无愧于木叶忍村的精英力量，纵然心中感到震惊，全部成员仍然没有发出任何声音。
如今的三代目火影大人，虽然刚刚带领大家取得第三次忍界大战的胜利，正是声誉鼎盛的时候，但终究岁月不饶人，年岁已大，此时选择激流勇退，不失为明智之举。
毕竟，大伙儿已经很久没有在一线战场看到火影大人的英姿了。
猿飞日斩深情地扫视了一圈众人，沉声道：“木叶飞舞之处，火亦生生不息。火光将会继续照亮村子，并且让新生的树叶发芽。以后，还请诸位像支持我那样，多多支持下一任火影，波风水门。“
站在猿飞日斩身后的波风水门向前一步，鞠躬行礼道：“还请大家勠力同心，共同发扬光大火之意志！”
对波风水门，大伙都很熟悉，他是忍者学校毕业的高材生，三忍之一的自来也的嫡系弟子，漩涡水户大人的姻亲，曾经的暗部队长，有着黄色闪光之称威震忍界的优秀青年忍者。。
佩戴着面具的宇智波止水心情激荡，大声喊道：“向三代目火影大人，四代目火影大人，敬礼！”
全体暗部成员挺直了身子，齐齐举手敬礼，异口同声喊道：“忠诚！”
宇智波一族，自木叶创建以来，便有着“半村一族”的称呼，既是说宇智波联手牵手一齐创建了木叶，也是说他们宇智波的族人占据了木叶忍村一半的土地。
整个火之国的财富，木叶占据一半，而宇智波一族的财富，又占据了木叶的一半，这就是豪门大族的底蕴所在。
现在，除了宇智波一族祭拜先祖的南贺神社，以及神社旁边的祖宅，绝大多数宇智波一族的房产、商铺、工厂、田产都被木叶以低于市场价一半的价格收购了。
宇智波的房子，是木叶最好的地段。
宇智波的商铺，是木叶最繁华之处。
宇智波的田产，是木叶最肥沃之地。
宇智波的工厂，是木叶最便利之所。
如果宇智波一族的经营一切正常，这些当然值很多钱。
但是现在，宇智波一族深陷债务危机。
只能是卖了，都贱卖了。
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