又不知多少个春秋在紫禁城的红墙黄瓦间悄然流逝，当年那个在烟火下欢呼雀跃的小小燕子，已出落成亭亭玉立的少女。而永琪，也在岁月磨砺中愈发成熟稳重，成为朝廷栋梁。这本该是一段水到渠成的皇室佳话，可命运的齿轮却在某个不经意间陡然一转。
彼时，民间突发罕见疫病，来势汹汹，蔓延极快，短短数日便让无数百姓陷入病痛与恐慌之中。疫情如火，迅速燃遍京城周边，甚至有向京城内扩散的趋势。弘历心急如焚，当即召集朝中大臣商议对策，可疫病诡异，诸多药方皆无明显成效。
小小燕子听闻此事，心急如焚，她自幼在宫中长大，虽享尽荣华，却也心怀悲悯。看着宫外百姓受苦，她坐立难安，毅然决定瞒着众人，女扮男装，偷偷溜出皇宫，前往疫区探寻疫病根源，寻找救治之法。
然而，这一去，便是泥牛入海。小小燕子在疫区奔波多日，虽结识了不少志同道合的民间医者，却也因频繁接触病患，不慎染病，昏迷不醒。民间医者全力救治，可疫情严重，药材稀缺，他们也束手无策。
与此同时，宫中发现小小燕子失踪，顿时乱作一团。弘历和小燕子焦急万分，派人四处寻找，却一无所获。永琪得知此事，心急如焚，不顾众人阻拦，亲自出宫寻找。
在民间苦苦寻觅多日后，永琪终于在一处简陋的医馆中找到了昏迷不醒的小小燕子。他心急如焚，将小小燕子带回皇宫，召集太医院所有太医会诊。经过太医们的全力救治，小小燕子终于脱离了生命危险，但因疫病后遗症，身体极为虚弱。
经此一遭，小小燕子深感自己虽贵为格格，却在疫病面前如此无力。她深知，若想真正帮助百姓，仅靠皇宫的力量远远不够。于是，病愈后的她向弘历和小燕子表明心意，决定放弃格格身份，成为一名普通民女，深入民间，学习医术，救助更多百姓。
弘历和小燕子虽满心不舍，但看着女儿坚定的眼神，最终还是忍痛答应。就这样，小小燕子告别皇宫，隐姓埋名，在民间开启了学医之路。她拜民间老医为师，日夜苦学，从辨认草药到研习医理，再到临床实践，每一步都走得艰难却坚定。
永琪虽心中牵挂，却也尊重小小燕子的决定。他时常在处理完朝中事务后，悄悄出宫，以普通书生的身份陪伴在小小燕子身边，为她排忧解难，陪她度过一个又一个难关。在这段日子里，两人的感情在相互扶持中愈发深厚。
多年后，小小燕子医术大成，在民间声名远扬，救治了无数百姓。而永琪，也在朝堂上屡立战功，成为百姓爱戴的皇子。这一年，当疫病再次来袭，小小燕子和永琪携手并肩，一个用医术治病救人，一个协调各方资源，最终成功控制住疫情。
疫病平息后，弘历和小燕子看着历经磨难却更加坚定的两人，心中满是欣慰。他们决定为小小燕子和永琪举办一场盛大的婚礼，让这段跨越身份与磨难的爱情修成正果。
大婚当日，紫禁城再次被喜庆的氛围笼罩。红绸飘舞，喜字高悬，百官朝贺，百姓欢呼。小小燕子身着凤冠霞帔，美得不可方物，永琪则身着蟒袍，气宇轩昂。两人携手步入礼堂，在众人的祝福声中，许下相伴一生的诺言，续写属于他们的传奇。
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