时光如同沉默的纺锤，在命运的织机上悄然穿梭。当黑泽光在夏威夷的阳光下过着隐士般的生活，琴酒在东京的阴影中用血腥手段巩固着他的黑暗帝国，降谷零在组织的核心地带如履薄冰地深潜，秋庭怜子用她那浸透悲伤与力量的歌声抚慰着无数心灵的同时，在东京都米花町这个看似平静祥和的地方，一个承载着特殊“世界之子”命运的孩子，正以一种近乎违背常理的速度，茁壮而耀眼地成长着。
工藤新一，这个继承了父亲工藤优作那缜密如超级计算机般的推理头脑，以及母亲工藤有希子（原着名女演员藤峰有希子）那足以乱真的表演天赋（这天赋在他身上，最初表现为惟妙惟肖地模仿各类人物，尤其是未来用于重现犯人犯罪时的神态动作）的男孩，从他蹒跚学步时起，就显得与周遭的普通孩子截然不同。
当邻里年龄相仿的孩子们还沉浸在奥特曼打小怪兽的电视节目、或者为最新的电动玩具和卡通贴纸欢呼雀跃时，年仅五岁的工藤新一，已经能够搬个小凳子，垫着脚，够到父亲书房里那排散发着油墨与旧纸张气息的书架，然后小心翼翼地抽出一本比他脸还大的、砖头般厚重的英文原版《福尔摩斯探案全集》，蜷缩在窗边的阳光里，看得如痴如醉。那些复杂的案件、精妙的逻辑推演、对人性的细微洞察，对他而言，远比任何彩色图画书都更具吸引力。
而到他六岁时，这种天赋已经不再是单纯的兴趣，而是化为了令人瞠目结舌的、实实在在的观察力与逻辑推理能力，开始在他日常生活的点点滴滴中绽放出不可思议的光芒。
在帝丹幼儿园向日葵班，他成了老师们又爱又怕的“小麻烦”。
午餐后分发的小饼干少了一块，保育员老师正在疑惑，小新一已经举起了手，用还带着奶气却条理清晰的声音指出：“是健太郎吃的。” 在老师惊讶的目光中，他继续解释：“健太郎的右边嘴角有没擦干净的饼干碎屑，和他今天穿的蓝色背心上沾到的糖霜颜色一样。而且，他刚才去洗手间回来时，脚步比平时快，右手一直捂着口袋，形状鼓鼓的。”
一次，保育园小花园里几株刚刚绽放的牵牛花苗被人齐根踩断了，孩子们面面相觑，无人承认。新一绕着那片“案发现场”走了两圈，然后指向一个平时很文静的小女孩：“是美咲酱，但不是故意的。” 他蹲下身，指着泥地上一个模糊的、带有特殊波浪纹路的鞋印，“这是美咲酱今天穿的鞋子底纹，旁边还有她掉下来的粉色小发卡。她刚才玩丢手绢跑过来时，被后面追的小哲撞了一下，没站稳，不小心踩到了花苗。你看，她眼睛红红的，一直在看那些花，很内疚的样子。”
起初，老师们只觉得这孩子观察细致，脑筋转得快，颇为有趣。但随着类似的事情一次次发生，从谁偷偷藏了别人的蜡笔，到谁撒谎说午睡做了噩梦其实是为了逃避不喜欢的水果……新一总能通过一些他们完全忽略的细节——衣服上不起眼的污渍、说话时一个不自然的停顿、玩具摆放位置的细微异常、甚至是一个眼神的躲闪——精准地揭开“真相”。老师们开始从惊讶转变为一种隐隐的不安甚至害怕。这孩子那双清澈的蓝眼睛，仿佛能穿透一切伪装，看到人心底最细微的波动，这在一个幼儿园的环境里，显得有些过于……犀利和早熟了。
在米花町的街道上，他则是父亲工藤优作身边一个移动的“人形观察站”。
父子俩一起出门散步，新一的小手被优作的大手牵着，但他的眼睛却像最精密的扫描仪，不断捕捉着路人的信息。他会突然拽拽优作的衣角，指着不远处一个行色匆匆的中年男人，小声而肯定地说：
“爸爸，你看那个叔叔。他的领带系歪了，左边袖口有一小块刚沾上不久的蓝色墨水痕迹，走路很快，神色很着急，一直看手表，但是眉头皱着，好像很不高兴。他 probably 是个上班快要迟到的公司职员，而且刚刚经历过一场不太愉快的会议，可能还被上司批评了，所以连领带都没心思整理好。”
优作顺着儿子的目光看去，往往能从那人的穿着、气质和新一指出的细节中，验证儿子的推断十有八九是准确的。这种能力，让身为世界知名推理小说家的优作，也时常感到惊叹。
然而，面对儿子如此早慧和锋芒毕露的天赋，优作和有希子这对父母的内心，充满了复杂的矛盾情感。
一方面，他们无法不为儿子的天才感到由衷的骄傲。新一所展现出的观察力、逻辑思维和联想能力，远超同龄人，甚至许多成年人都望尘莫及。这无疑是上天赐予的宝贵礼物，也让他们看到了未来无限的可能性。
但另一方面，深沉的担忧也如影随形。他们担忧这过早显露的、如同出鞘利剑般的锋芒，会在不经意间刺伤他人，让新一难以融入普通的孩童群体，失去本该拥有的简单快乐与懵懂童年。他们更害怕，这种“看穿一切”的能力，如果被有心人注意到，或者未来被他用于不恰当的地方，可能会给他自身带来无法预料的危险。世界的黑暗面，远非一个六岁孩子所能想象和理解。
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