三清成圣，玄门大兴，洪荒看似进入了一个相对平稳的时期。然而，旧的矛盾并未消解，反而在圣人光辉的映照下，愈发尖锐。
巫族掌地，妖族掌天，两族势力庞大，摩擦日益加剧。而巫族内部，亦非铁板一块。
水神共工与火神祝融，因争夺部族利益与道途理念不合，积怨已久，终至爆发惊天大战。两位祖巫皆是准圣巅峰修为，神通惊天动地，从大地一路战至九天，打得山河崩碎，星辰摇曳！
最终，共工不敌祝融，惨败之下，怒极攻心，竟一头撞向了支撑天地、连接天界的擎天之柱——不周山！
“轰隆隆——！！！”
天柱折断！苍穹倾覆！天河之水自缺口倒灌而下，洪荒大地瞬间陷入一片汪洋！无数生灵涂炭，怨气冲天！
天崩地裂，灾祸蔓延，危及整个洪荒。
已成圣的女娲娘娘心生感应，叹息一声，不得不出手。她采集五色神石，熔炼乾坤鼎，以无上造化神通炼石补天，堵住了苍穹缺口，止住了天河之水。
随后，她又斩北海玄龟之足，重新立起四极，暂时稳定了天地。
然而，天柱已断，天地连接不再稳固，洪荒灵气开始缓慢流失，进入“末法”的开端。女娲补天虽是大功德，却也耗损颇大，且因妖族身份，在此劫中处境微妙，战后更不便插手巫妖之事。
不周山倒，天界震荡。妖族太子，帝俊十子——十只三足金乌，因受惊或顽劣，竟一同飞出汤谷，巡游洪荒！
十日当空，炙烤大地！江河干涸，草木成灰，生灵死伤无数！
大巫夸父见状怒不可遏，挺身而出，逐日而行，欲驱赶金乌，却因力竭而被活活晒死、渴死！
好友夸父之死，彻底激怒了另一位顶尖大巫——后羿！他取来盘古弓、射日神箭，含怒出手，箭无虚发，一连射杀九只金乌太子！
仅存的小金乌陆压仓皇逃回天庭。
九位太子陨落，帝俊与东皇太一悲痛欲绝，与巫族的仇恨再无转圜余地！妖族倾巢而出，疯狂报复巫族，袭杀后羿失败后羲和还使出了美人计，从人族找到嫦娥，让她把后羿从西王母处得到的神药吃了，妖族屠戮巫族部落，巫妖全面战争，彻底爆发！
这场席卷天地的浩劫背后，亦有圣人推手。
女娲娘娘因出身妖族，且刚补天损耗巨大，被天道与其他圣人暗示，不便直接参战，同时她亦有私心，也就是人族。
西方接引、准提二圣，乐于见到玄门背景的妖族与盘古血脉的巫族两败俱伤，暗中推波助澜，削弱两族气运，为他们西方教未来东传和人族崛起腾出空间。
三清圣人超然物外，静观其变，默认此乃天道循环，旧霸主当为新生力量让路。
巫族摆下十二都天神煞大阵，召唤盘古真身，欲以力破法，重定地水火风！
妖族则依靠东皇太一执掌的先天至宝混沌钟与帝俊推演出的周天星斗大阵，引动太古星辰之力，与之抗衡！
两座绝世大阵对撞，打得洪荒破碎，星辰陨落，万物凋零！无数大巫、妖神陨落，血染长空！连祖巫与妖皇也纷纷遭受重创！
就在巫妖二族血战不休、两败俱伤之际，一直被忽视的人族，因其强大的繁衍能力、坚韧的求生意志以及对圣人们（尤其是女娲、老子）的虔诚信仰，竟在废墟中顽强地生存、发展起来。他们数量庞大，虽个体弱小，却凝聚了庞大的生灵愿力与气运。
天道感应，气运转移！人族正式成为洪荒天地主角！
巫妖大战终至尾声，两族精锐几乎损失殆尽，祖巫接连战死，帝俊、东皇太一亦相继陨落于惨烈的大战之中，混沌钟失落无踪，巫妖二族退出历史舞台，残存势力退守偏远之地，苟延残喘。
洪荒不可无主。天道显化，鸿钧道祖法旨降下：命其紫霄宫中随身童子、童女，下界转世历劫，积累功德，以承天命。
童子历劫圆满，归来之日，受封为昊天金阙无上至尊自然妙有弥罗至真玉皇上帝，即玉皇大帝，执掌天庭，统御三界十方四生六道！
童女亦历劫圆满，受封为王母娘娘，与西昆仑的那位先天神只西王母并非一人，西王母仍在自身道场静修，辅佐玉帝，掌管女仙与瑶池蟠桃园。
新天庭于三十三天重立，开始招募散仙，构建秩序，然根基尚浅，权威未立。
洪荒天地，自此进入人族为天地主角、新天庭初立、圣人垂拱而治的全新时代。然而，旧的劫难虽过，新的风波却已在酝酿。封神之劫的阴影，悄然浮现…
碧游宫中，莲蕊静观这场天地巨变，心中波澜起伏。
“巫妖大战落幕了。人族当兴，天庭重立，封神之劫，快要来了。”她深吸一口气，眼神变得锐利起来，“我的准备，必须更快了！要在那场大劫来临前，拥有足够的实力和筹码！”
三清虽同为玄门圣人，但因教义理念差异巨大，门下弟子摩擦渐多。
元始天尊认为通天教主有教无类，门下多为“披毛戴角、湿生卵化”之辈，不堪造就，有辱玄门清誉。
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